{"id":3775,"date":"2025-04-10T10:00:57","date_gmt":"2025-04-10T09:00:57","guid":{"rendered":"https:\/\/mag.inrameknes.info\/?p=3775"},"modified":"2025-04-10T10:22:16","modified_gmt":"2025-04-10T09:22:16","slug":"deperissement-des-agrumes-identification-des-maladies-fongiques-emergentes-dans-les-perimetres-du-gharb-et-du-tadla","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/mag.inrameknes.info\/?p=3775","title":{"rendered":"D\u00c9P\u00c9RISSEMENT DES AGRUMES : IDENTIFICATION DES MALADIES FONGIQUES \u00c9MERGENTES DANS LES P\u00c9RIM\u00c8TRES DU GHARB ET DU TADLA"},"content":{"rendered":"\n

<\/p>\n\n\n\n

Zineb Belabess1<\/sup>, Meriem Azzouz2, 3<\/sup>, Abdessalem Tahiri3<\/sup>, Rachid Lahlali3<\/sup><\/h3>\n\n\n\n
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1 <\/sup>INRA CRRA Mekn\u00e8s – 2<\/sup> INRA CRRA Tanger – 3<\/sup> ENA Mekn\u00e8s.<\/p>\n<\/blockquote>\n\n\n

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Dr Zineb Belabess, Chercheure
Virologie V\u00e9g\u00e9tale
URPP – INRA CRRA Mekn\u00e8s<\/figcaption><\/figure><\/div>\n\n\n

Le d\u00e9p\u00e9rissement des agrumes est une menace \u00e9mergente pour la production agrumicole mondiale (Afzal et al., 2021; Fayyaz et al., 2020; Riolo et al., 2021; Wang et al., 2021). Il entra\u00eene des pertes de rendement, y compris la mort des arbres (Fayyaz et al., 2020). Dans la pr\u00e9sente \u00e9tude, le terme \u00ab maladies de d\u00e9p\u00e9rissement \u00bb d\u00e9signe des infections vari\u00e9es par leur nature, mais qui pr\u00e9sentent g\u00e9n\u00e9ralement une \u00e9volution lente, menant souvent \u00e0 la mort de la plante enti\u00e8re. Le syndrome des agrumes connu sous le nom de \u00ab maladie de d\u00e9p\u00e9rissement des rameaux et des pousses \u00bb est caus\u00e9 par des esp\u00e8ces de Colletotrichum spp<\/em>. [Sordariomycetes ; Glomerellaceae<\/em>] (Afzal et al., 2021; Fayyaz et al., 2020; Mayorquin et al., 2019; Ramos et al., 2016; Riolo et al., 2021; Wang et al., 2021). Bien que ces esp\u00e8ces soient reconnues comme agents pathog\u00e8nes des agrumes responsables des anthracnoses des feuilles et des fruits, leur r\u00f4le dans le d\u00e9p\u00e9rissement des rameaux et des pousses est devenu plus pro\u00e9minent r\u00e9cemment (Mayorquin et al., 2019). Par ailleurs, la maladie de d\u00e9p\u00e9rissement des rameaux et des pousses d’agrumes est d\u00e9sormais consid\u00e9r\u00e9e comme un nouveau syndrome dans la r\u00e9gion m\u00e9diterran\u00e9enne (Riolo et al., 2021). Le d\u00e9p\u00e9rissement des arbres d\u2019agrumes peut \u00e9galement \u00eatre caus\u00e9 par des champignons du genre Alternaria <\/em>[Pleosporales ; Pleosporaceae<\/em>] (Alwan et Mohemed, 2021) et par des esp\u00e8ces de la famille des Botryosphaeriaceae <\/em>(Berraf-tebbal et al., 2020). Au Maroc, nos visites r\u00e9guli\u00e8res dans les vergers agrumicoles de la zone de Berkane et du Gharb ont permis d\u2019observer fr\u00e9quemment des sympt\u00f4mes de d\u00e9p\u00e9rissement. Les \u00e9chantillons collect\u00e9s ont r\u00e9agi n\u00e9gativement aux tests de d\u00e9tection de certaines maladies de d\u00e9p\u00e9rissement d\u2019origine virale (comme la tristeza et la psorose) et bact\u00e9rienne (notamment le stubborn) (Belabess et al., 2020). Pour faire face \u00e0 cette situation, le d\u00e9veloppement de strat\u00e9gies de contr\u00f4le des agents responsables de ce d\u00e9p\u00e9rissement est crucial pour garantir une production agrumicole durable. L’efficacit\u00e9 de ces strat\u00e9gies repose sur une bonne compr\u00e9hension de l\u2019\u00e9cologie et de l\u2019\u00e9pid\u00e9miologie des agents phytopathog\u00e8nes impliqu\u00e9s. C\u2019est dans ce contexte que cette \u00e9tude utilise diverses m\u00e9thodes microbiologiques pour identifier les champignons potentiellement associ\u00e9s au d\u00e9p\u00e9rissement observ\u00e9 dans certaines plantations agrumicoles des p\u00e9rim\u00e8tres du Gharb et du Tadla.<\/p>\n\n\n\n\n\n\n\n

Collecte, identification et \u00e9valuation pathologique des champignons associ\u00e9s aux sympt\u00f4mes de d\u00e9p\u00e9rissement des agrumes<\/h2>\n\n\n\n

Des \u00e9chantillons de rameaux (1350) et de feuilles (400) provenant d\u2019arbres symptomatiques (Figure 1<\/strong>) ont \u00e9t\u00e9 collect\u00e9s dans deux des principaux p\u00e9rim\u00e8tres de production des agrumes au Maroc, \u00e0 savoir le Gharb et le Tadla. Tous les \u00e9chantillons ont \u00e9t\u00e9 soumis \u00e0 des techniques d’isolement, de repiquage et de purification des colonies fongiques potentiellement associ\u00e9es aux sympt\u00f4mes observ\u00e9s sur le terrain. L’identification des champignons a \u00e9t\u00e9 r\u00e9alis\u00e9e \u00e0 partir d\u2019une caract\u00e9risation morphologique (macroscopique et microscopique) et mol\u00e9culaire par PCR, avec s\u00e9quen\u00e7age de la r\u00e9gion interne transcrite (ITS). Enfin, des tests de pathog\u00e9nicit\u00e9 ont \u00e9t\u00e9 r\u00e9alis\u00e9s pour v\u00e9rifier les postulats de Koch concernant les champignons identifi\u00e9s. Ces \u00e9valuations ont \u00e9t\u00e9 men\u00e9es conform\u00e9ment \u00e0 la m\u00e9thodologie \u00e9tablie par Diogo et al<\/em>. (2010) pour d\u00e9terminer la capacit\u00e9 de ces isolats \u00e0 induire des sympt\u00f4mes pathologiques sur les rameaux du bigaradier.<\/p>\n\n\n\n

Le d\u00e9p\u00e9rissement des agrumes est une menace \u00e9mergente pour la production agrumicole mondiale (Afzal et al., 2021; Fayyaz et al., 2020; Riolo et al., 2021; Wang et al., 2021). Il entra\u00eene des pertes de rendement, y compris la mort des arbres (Fayyaz et al., 2020). Dans la pr\u00e9sente \u00e9tude, le terme \u00ab maladies de d\u00e9p\u00e9rissement \u00bb d\u00e9signe des infections vari\u00e9es par leur nature, mais qui pr\u00e9sentent g\u00e9n\u00e9ralement une \u00e9volution lente, menant souvent \u00e0 la mort de la plante enti\u00e8re. Le syndrome des agrumes connu sous le nom de \u00ab maladie de d\u00e9p\u00e9rissement des rameaux et des pousses \u00bb est caus\u00e9 par des esp\u00e8ces de Colletotrichum spp<\/em>. [Sordariomycetes ; Glomerellaceae<\/em>] (Afzal et al., 2021; Fayyaz et al., 2020; Mayorquin et al., 2019; Ramos et al., 2016; Riolo et al., 2021; Wang et al., 2021). Bien que ces esp\u00e8ces soient reconnues comme agents pathog\u00e8nes des agrumes responsables des anthracnoses des feuilles et des fruits, leur r\u00f4le dans le d\u00e9p\u00e9rissement des rameaux et des pousses est devenu plus pro\u00e9minent r\u00e9cemment (Mayorquin et al., 2019). Par ailleurs, la maladie de d\u00e9p\u00e9rissement des rameaux et des pousses d’agrumes est d\u00e9sormais consid\u00e9r\u00e9e comme un nouveau syndrome dans la r\u00e9gion m\u00e9diterran\u00e9enne (Riolo et al., 2021). Le d\u00e9p\u00e9rissement des arbres d\u2019agrumes peut \u00e9galement \u00eatre caus\u00e9 par des champignons du genre Alternaria <\/em>[Pleosporales ; Pleosporaceae<\/em>] (Alwan et Mohemed, 2021) et par des esp\u00e8ces de la famille des Botryosphaeriaceae <\/em>(Berraf-tebbal et al., 2020). Au Maroc, nos visites r\u00e9guli\u00e8res dans les vergers agrumicoles de la zone de Berkane et du Gharb ont permis d\u2019observer fr\u00e9quemment des sympt\u00f4mes de d\u00e9p\u00e9rissement. Les \u00e9chantillons collect\u00e9s ont r\u00e9agi n\u00e9gativement aux tests de d\u00e9tection de certaines maladies de d\u00e9p\u00e9rissement d\u2019origine virale (comme la tristeza et la psorose) et bact\u00e9rienne (notamment le stubborn) (Belabess et al., 2020). Pour faire face \u00e0 cette situation, le d\u00e9veloppement de strat\u00e9gies de contr\u00f4le des agents responsables de ce d\u00e9p\u00e9rissement est crucial pour garantir une production agrumicole durable. L’efficacit\u00e9 de ces strat\u00e9gies repose sur une bonne compr\u00e9hension de l\u2019\u00e9cologie et de l\u2019\u00e9pid\u00e9miologie des agents phytopathog\u00e8nes impliqu\u00e9s. C\u2019est dans ce contexte que cette \u00e9tude utilise diverses m\u00e9thodes microbiologiques pour identifier les champignons potentiellement associ\u00e9s au d\u00e9p\u00e9rissement observ\u00e9 dans certaines plantations agrumicoles des p\u00e9rim\u00e8tres du Gharb et du Tadla.<\/p>\n\n\n\n

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Identification et pr\u00e9valence des esp\u00e8ces fongiques dans les rameaux et feuilles d\u2019agrumes<\/h2>\n\n\n\n

Parmi les principaux genres de champignons identifi\u00e9s, Colletotrichum<\/em> (40,8 %) est le plus pr\u00e9valent, suivi d\u2019Alternaria<\/em> (14,3 %) et de Fusarium<\/em> (12,2 %). Diaporthe<\/em> et Dothiorella<\/em> (4 % chacun), ainsi que Diplodia<\/em> et Stemphylium<\/em> (2 % chacun), sont \u00e9galement pr\u00e9sents. Les autres isolats (20,4 %) appartiennent \u00e0 des genres non identifi\u00e9s.<\/p>\n\n\n

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Figure 2 :<\/strong> Principaux genres de champignons isol\u00e9s \u00e0 partir des \u00e9chantillons de rameaux d\u2019arbres d\u2019agrumes manifestant des sympt\u00f4mes de d\u00e9p\u00e9rissement dans les p\u00e9rim\u00e8tres du Gharb et du Tadla. Les pourcentages sont relatifs au nombre total d\u2019isolats obtenus (326).<\/em><\/figcaption><\/figure><\/div>\n\n\n

Les esp\u00e8ces de Colletotrichum<\/em> (notamment C. boninense<\/em>, C. catinaense<\/em>, C. gloeosporioides<\/em>, C. karsti<\/em>, C. phyllanthi<\/em>, C. cymbidiicola<\/em>, C. fructicola<\/em> et C. petchii<\/em>) se sont r\u00e9v\u00e9l\u00e9es \u00eatre les plus fr\u00e9quemment observ\u00e9es dans les 35 vergers \u00e9tudi\u00e9s. Ces r\u00e9sultats sont coh\u00e9rents avec ceux de Wang et al<\/em>. (2021), qui ont constat\u00e9 que Colletotrichum<\/em> spp. \u00e9tait le genre le plus fr\u00e9quemment isol\u00e9 \u00e0 partir d’agrumes malades. Nous avons \u00e9galement identifi\u00e9 des esp\u00e8ces d\u2019Alternaria<\/em> (A. alstroemeriae<\/em>, A. alternata<\/em>, A. arborescens<\/em>, A. tenuissima<\/em>), de Fusarium<\/em> (F. equiseti<\/em>, F. longifundum<\/em>, F. oxysporum<\/em>), de Diaporthe<\/em> (D. citri<\/em>), de Diplodia<\/em> (D. seriata<\/em>), ainsi que de Stemphylium<\/em> (S. amaranthi<\/em>) et Dothiorella<\/em> (D. viticola<\/em>) (Figures 3-4).<\/p>\n\n\n\n

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\u00c9valuation de la pathog\u00e9nicit\u00e9 des isolats phytopathog\u00e8nes sur agrumes<\/h2>\n\n\n\n

Dans cette \u00e9tude, un total de 3 isolats potentiellement pathog\u00e8nes provenant des feuilles et de 15 isolats des rameaux ont \u00e9t\u00e9 soigneusement \u00e9valu\u00e9s pour leur pathog\u00e9nicit\u00e9. Les r\u00e9sultats montrent que toutes les esp\u00e8ces test\u00e9es sont phytopathog\u00e8nes, provoquant des dommages visibles sur les rameaux et les feuilles inocul\u00e9s (Figure 5<\/strong>). Tous les isolats se sont r\u00e9v\u00e9l\u00e9s pathog\u00e8nes, D. citri<\/em> \u00e9tant l’esp\u00e8ce la plus virulente. Les tests de pathog\u00e9nicit\u00e9 montrent les effets n\u00e9fastes des isolats pathog\u00e8nes provenant des deux r\u00e9gions \u00e9tudi\u00e9es, entra\u00eenant des l\u00e9sions n\u00e9crotiques de diff\u00e9rentes tailles sur les jeunes rameaux de bigaradier \u00e2g\u00e9s d’un an, ainsi qu’un jaunissement prononc\u00e9 des nervures et l’enroulement des feuilles saines. Ces observations confirment la s\u00e9v\u00e9rit\u00e9 des isolats analys\u00e9s et leur capacit\u00e9 \u00e0 causer des dommages significatifs aux rameaux et feuilles d\u2019agrumes.<\/p>\n\n\n

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Conclusions et perspectives<\/h2>\n\n\n\n

Cette \u00e9tude constitue la premi\u00e8re identification exhaustive des esp\u00e8ces fongiques \u00e9mergentes dans les zones agrumicoles du Gharb et du Tadla. Bien que les r\u00e9sultats soient pr\u00e9liminaires, ils ouvrent la voie \u00e0 de futures recherches. Il serait pertinent de compl\u00e9ter l\u2019identification des isolats fongiques rapport\u00e9s dans cette \u00e9tude et d\u2019\u00e9valuer leur pathog\u00e9nicit\u00e9. Par ailleurs, il serait envisageable de s\u00e9lectionner des vari\u00e9t\u00e9s d’agrumes r\u00e9sistantes ou tol\u00e9rantes aux champignons pathog\u00e8nes isol\u00e9s, afin de r\u00e9duire la vuln\u00e9rabilit\u00e9 des cultures.<\/p>\n\n\n\n

R\u00e9f\u00e9rences consult\u00e9es<\/u><\/strong><\/p>\n\n\n\n

Afzal, M.U., Khan, S.A., Javid, N., Malik, A.U., 2021. Synergism of citrus nematode (Tylenchulus semipenetrans Cobb.) and Colletotrichum gloeosporioides plays a major role in citrus dieback. Pakistan J. Agric. Sci. 58, 1291\u20131299. https:\/\/doi.org\/10.21162\/PAKJAS\/21.399<\/p>\n\n\n\n

Alwan, S.L., Mohemed, S.A., 2021. Molecular Diagnosis of Alternaria spp . Causing Citrus Dieback in Central Iraq. Ann. Rom. Soc. Cell Biol. 25, 10082\u201310093.<\/p>\n\n\n\n

Belabess, Z., Afechtal, M., Benyazid, J., Sagouti, T., Rhallabi, N., 2020. Pr\u00e9valence des phytovirus associ\u00e9s aux agrumes dans la r\u00e9gion de Berkane. African Mediterr. Agric. Journal-Al Awamia 129, 144\u2013160.<\/p>\n\n\n\n

Berraf-tebbal, A., Mahamedi, A.E., Aigoun-mouhous, W., Spetik, M., Cechova, J., Pokluda, R., Baranek, M., Eichmeier, A., Alves, A., 2020. Lasiodiplodia mitidjana sp. nov. and other Botryosphaeriaceae species causing branch canker and dieback of Citrus sinensis in Algeria. PLoS One 15, e0232448. https:\/\/doi.org\/10.1371\/journal.pone.0232448<\/p>\n\n\n\n

Diogo, E.L.F., Santos, J.M., Phillips, A.J.L., 2010. Phylogeny, morphology and pathogenicity of Diaporthe and Phomopsis species on almond in Portugal. Fungal Divers. 44, 107\u2013115. https:\/\/doi.org\/10.1007\/s13225-010-0057-x<\/p>\n\n\n\n

Fayyaz, A., Sahi, S.T., Nawaz-ul-Reliman, M.S., Amrao, L., 2020. Molecular Characterization of Fungal Pathogens Associated with Citrus Molecular Characterization of Fungal Pathogens Associated with Citrus Withertip \/ Dieback from Major Citrus Growing Areas of Punjab , Pakistan. Int. J. Agric. Biol. 23, 1165\u20131170. https:\/\/doi.org\/10.17957\/IJAB\/15.1400<\/p>\n\n\n\n

Mayorquin, J.S., Nouri, M.T., Peacock, B.B., Trouillas, F.P., Douhan, G.W., 2019. Identification, Pathogenicity, and Spore Trapping of Colletotrichum karstii Associated with Twig and Shoot Dieback of Clementine Mandarin and Navel Orange in California. Plant Dis. 103, 1464\u20131473. https:\/\/doi.org\/10.1094\/PDIS-08-18-1425-RE<\/p>\n\n\n\n

Ramos, A.P., Talhinhas, P., Sreenivasaprasad, S., Oliveira, H., 2016. Characterization of Colletotrichum gloeosporioides, as the main causal agent of citrus anthracnose, and C . karstii as species preferentially associated with lemon twig dieback in Portugal. Phytoparasitica 44, 549\u2013561. https:\/\/doi.org\/10.1007\/s12600-016-0537-y<\/p>\n\n\n\n

Riolo, M., Aloi, F., Pane, A., Cara, M., Cacciola, S.O., 2021. Twig and Shoot Dieback of Citrus , a New Disease Caused by Colletotrichum Species. Cells 10, 1\u201323. https:\/\/doi.org\/https:\/\/doi.org\/10.3390\/cells10020449<\/p>\n\n\n\n

Wang, W., de Silva, D.D., Moslemi, A., Edwards, J., Ades, P.K., Crous, P.W., Taylor, P.W.J., 2021. Colletotrichum Species Causing Anthracnose of Citrus in Australia. J. Fungi 7, 1\u201324. https:\/\/doi.org\/https:\/\/doi.org\/10.3390\/jof7010047.<\/p>\n\n\n\n

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