{"id":3563,"date":"2024-04-18T16:08:22","date_gmt":"2024-04-18T15:08:22","guid":{"rendered":"https:\/\/mag.inrameknes.info\/?p=3563"},"modified":"2024-04-19T21:51:43","modified_gmt":"2024-04-19T20:51:43","slug":"la-selection-de-lolivier-a-lere-de-la-genomique-quels-apports-pour-lamelioraton-genetique-de-lespece","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/mag.inrameknes.info\/?p=3563","title":{"rendered":"LA SELECTION DE L\u2019OLIVIER A L\u2019ERE DE LA GENOMIQUE\u00a0: QUELS APPORTS POUR L\u2019AMELIORATON GENETIQUE DE L\u2019ESPECE\u00a0?"},"content":{"rendered":"
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Lamoumni Othmane,<\/strong>
PhD student
INRA CRRA Mekn\u00e8s – UCA FST Marrakech<\/figcaption><\/figure><\/div>\n\n\n

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Par : Lamoumni Othmane1,2<\/sup>, Khadari Bouchaib3,4<\/sup>, El Bakkali Ahmed2<\/sup><\/strong><\/h2>\n\n\n\n

1<\/sup>Universit\u00e9 Cadi Ayyad, Marrakech ; 2<\/sup>INRA, CRRA-Mekn\u00e8s ;<\/p>\n\n\n\n

3<\/sup>AGAP Institut, CIRAD, Montpellier, France ; 4<\/sup>CBNMed Montpellier, France<\/p>\n<\/div>\n<\/div>\n<\/div>\n\n\n\n

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L\u2019olivier, arbre caract\u00e9ristique de la r\u00e9gion m\u00e9diterran\u00e9enne, se trouve confront\u00e9 aux contraintes li\u00e9es au changement climatique marqu\u00e9s par des hivers de plus en plus doux et des \u00e9t\u00e9s plus secs, chauds et longs. L\u2019impact de ce changement sur l\u2019olivier constitue un d\u00e9fi majeur pour la r\u00e9silience et la durabilit\u00e9 de l\u2019ol\u00e9iculture non seulement au Maroc mais \u00e0 l\u2019\u00e9chelle m\u00e9diterran\u00e9enne. Devant cette situation, la recherche scientifique devrait explorer plusieurs voies pour r\u00e9pondre aux attentes de la fili\u00e8re dans les prochaines ann\u00e9es. De par sa longue histoire \u00e9volutive en M\u00e9diterran\u00e9e depuis plus de 6000 ans, l\u2019olivier est caract\u00e9ris\u00e9 par une grande diversit\u00e9 g\u00e9n\u00e9tique o\u00f9 plus de 1200 vari\u00e9t\u00e9s sont d\u00e9crites et conserv\u00e9es en collections sans consid\u00e9rer les oliviers locaux non encore caract\u00e9ris\u00e9s et les populations sauvages d\u2019olivier in-situ<\/em>. Cette richesse en ressources g\u00e9n\u00e9tiques repr\u00e9sente un r\u00e9servoir de g\u00e8nes et de caract\u00e8res \u00e0 valoriser dans les programmes d\u2019am\u00e9lioration g\u00e9n\u00e9tique en vue de s\u00e9lectionner de nouvelles vari\u00e9t\u00e9s plus r\u00e9silientes aux conditions climatiques futures. Etant un arbre p\u00e9renne caract\u00e9ris\u00e9 par une longue phase juv\u00e9nile, la s\u00e9lection de nouvelles vari\u00e9t\u00e9s par les voies classiques est un processus long et co\u00fbteux \u00e0 cause du temps et de l\u2019espace n\u00e9cessaires \u00e0 l\u2019\u00e9valuation ph\u00e9notypique de g\u00e9notypes candidats \u00e0 la s\u00e9lection. Les programmes d\u2019am\u00e9lioration g\u00e9n\u00e9tique devraient prendre en consid\u00e9ration les nouvelles avanc\u00e9es en g\u00e9nomique pour pouvoir acc\u00e9l\u00e9rer la s\u00e9lection vari\u00e9tale tout en r\u00e9pondant aux nouvelles attentes de la fili\u00e8re dans un contexte de changements globaux.<\/p>\n\n\n\n\n\n\n\n

Progr\u00e8s significatifs et prometteurs dans la g\u00e9nomique de l\u2019olivier<\/strong><\/h2>\n\n\n
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Les travaux sur l\u2019olivier ont longtemps \u00e9t\u00e9 ax\u00e9s sur la caract\u00e9risation et l\u2019identification des ressources g\u00e9n\u00e9tiques en vue de conna\u00eetre la diversit\u00e9 locale au niveau de chaque pays ol\u00e9icole. Les premiers travaux ont \u00e9t\u00e9 bas\u00e9s sur l\u2019utilisation des marqueurs de type RAPD, ISSR, RFLP, et AFLP pour l\u2019identification et la caract\u00e9risation de l\u2019olivier cultiv\u00e9 et\/ou sauvage. La mise en place des marqueurs sp\u00e9cifiques \u00e0 l\u2019olivier de type microsatellites (SSR) a apport\u00e9 de nouvelles perspectives dans les travaux sur l\u2019esp\u00e8ce. Gr\u00e2ce \u00e0 leur reproductibilit\u00e9, simplicit\u00e9 et leur pouvoir discriminant \u00e9lev\u00e9, les SSR sont devenus des marqueurs de choix dans les travaux portant sur la g\u00e9n\u00e9tique de l\u2019olivier tels que : (i) la caract\u00e9risation et l\u2019identification des ressources g\u00e9n\u00e9tiques, (ii) l\u2019\u00e9tude de son histoire \u00e9volutive de domestication et de diversification \u00e0 l\u2019\u00e9chelle m\u00e9diterran\u00e9enne (Besnard et al., 2018), et (iii) la construction des cartes g\u00e9n\u00e9tiques pour la localisation des QTLs (Quantitative Traits Loci<\/em>) associ\u00e9s \u00e0 des traits ph\u00e9notypiques.<\/p>\n\n\n\n

D\u2019autres \u00e9tudes ont port\u00e9 sur la mise en place d\u2019outils de g\u00e9notypage haut-d\u00e9bit relativement peu co\u00fbteux \u00e0 savoir le g\u00e9notypage par s\u00e9quen\u00e7age (Genotyping By Sequencing<\/em>; GBS) permettant de combiner entre l\u2019identification de variants mol\u00e9culaires \u00e0 l\u2019\u00e9chelle du g\u00e9nome et le g\u00e9notypage de plusieurs \u00e9chantillons \u00e0 la fois. Toutefois, l\u2019utilisation de cette approche chez l\u2019olivier reste limit\u00e9e et tr\u00e8s peu de travaux ont \u00e9t\u00e9 r\u00e9alis\u00e9s jusqu\u2019\u00e0 pr\u00e9sent aussi bien pour l\u2019\u00e9tude de la diversit\u00e9 g\u00e9n\u00e9tique (D\u2019Agostino et al., 2018 ; Zhu et al., 2019 ; Julca et al., 2020) que pour la g\u00e9n\u00e9tique des caract\u00e8res (cartographie de liaison et g\u00e9n\u00e9tique d\u2019association) (\u0130pek et al., 2016 & 2017 ; Marchese et al., 2016 ; Kaya et al., 2019).<\/p>\n\n\n\n

La r\u00e9duction des co\u00fbts de s\u00e9quen\u00e7age haut-d\u00e9bit a encourag\u00e9 la conception des projets d\u2019assemblage des g\u00e9nomes des esp\u00e8ces d\u2019int\u00e9r\u00eat agronomique. Chez l\u2019olivier, une premi\u00e8re tentative de s\u00e9quen\u00e7age et d\u2019assemblage du g\u00e9nome complet de la vari\u00e9t\u00e9 \u00ab Farga \u00bb a fait l\u2019objet d\u2019une publication d\u2019un g\u00e9nome sous forme de s\u00e9quences d\u2019ADN sans affectation aux chromosomes (version Oe6 ; Cruz et al., 2016). Cette premi\u00e8re version a \u00e9t\u00e9 am\u00e9lior\u00e9e en ancrant le g\u00e9nome sur une carte g\u00e9n\u00e9tique permettant ainsi une meilleure assignation des s\u00e9quences assembl\u00e9es aux diff\u00e9rents chromosomes de l\u2019olivier (version Oe9 ; Julca et al., 2020). En utilisant la m\u00eame approche que celle de Julca et al. (2020), un autre g\u00e9nome d\u2019un olivier sauvage (Olea europaea var. sylvestris<\/em>) a \u00e9t\u00e9 aussi assembl\u00e9 et publi\u00e9 par Unver et al. (2017). Ce retard dans l\u2019acquisition des ressources g\u00e9nomiques est principalement d\u00fb \u00e0 la taille \u00e9lev\u00e9e du g\u00e9nome de l\u2019olivier, estim\u00e9 \u00e0 1,4 GB, et \u00e0 la proportion \u00e9lev\u00e9e des motifs en r\u00e9p\u00e9tition ce qui rend difficile et co\u00fbteux un assemblage de qualit\u00e9 \u00e0 l\u2019\u00e9chelle chromosomique. Gr\u00e2ce au progr\u00e8s technologique r\u00e9alis\u00e9 dans la troisi\u00e8me g\u00e9n\u00e9ration de s\u00e9quen\u00e7age et la combinaison de plusieurs technologies bas\u00e9es sur des Long-reads<\/em> (PacBio HiFi<\/em>, Oxford Nanopore<\/em>, et Hi-C),<\/em> il est devenu possible de r\u00e9aliser un assemblage de qualit\u00e9 avec un co\u00fbt raisonnable. Gr\u00e2ce \u00e0 ces nouvelles technologies, Rao et al., (2021) et Wang et al. (2022) ont pu mettre en place les premiers g\u00e9nomes de qualit\u00e9 suffisante de la vari\u00e9t\u00e9 \u00ab Arbequina \u00bb et d\u2019O. europaea<\/em> ssp. Cuspidata<\/em>, respectivement.<\/p>\n\n\n\n

Le g\u00e9nome seul n\u2019est pas suffisant pour comprendre la fonction des g\u00e8nes chez l\u2019esp\u00e8ce. Des progr\u00e8s significatifs ont \u00e9t\u00e9 r\u00e9alis\u00e9s dans l\u2019analyse du transcriptome (partie codante du g\u00e9nome) en mettant l\u2019accent sur l\u2019identification des g\u00e8nes potentiellement exprim\u00e9s dans les diff\u00e9rents organes de l\u2019arbre (Mu\u00f1oz-M\u00e9rida et al., 2013 ; Unver et al., 2017 ; Liu et al., 2020 ; Ram\u00edrez-Tejero et al., 2020), au cours du d\u00e9veloppement du fruit (Alagna et al., 2009 ; Galla et al., 2009), sous stress abiotique (Calvo-Polancoa et al., 2019 ; Bazakos et al., 2012 ; Mousavi et al., 2019) ou biotique tels que : Xylella fastidiosa<\/em> (Giampetruzzi et al., 2016), Verticillium dahliae<\/em> (Perez et al., 2017 ; Jim\u00e9nez-Ruiz et al., 2019) et Bactrocera oleae<\/em> (Grasso et al., 2017). Ainsi, Unver et al. (2017) et Rao et al. (2021) ont pu pr\u00e9dire plus de 50 mille g\u00e8nes codants pour des prot\u00e9ines dont 93% ont \u00e9t\u00e9 confirm\u00e9s par l\u2019approche RNA-seq<\/em> \u00e0 partir des feuilles, des racines et des fruits \u00e0 diff\u00e9rents stades.<\/p>\n\n\n\n

Malgr\u00e9 l\u2019importance de la fili\u00e8re et les avanc\u00e9es technologiques r\u00e9alis\u00e9es par les diff\u00e9rentes \u00e9quipes de recherche aussi bien dans l\u2019acquisition des donn\u00e9es g\u00e9nomiques que dans le traitement bio-informatique des donn\u00e9es, les \u00e9tudes du d\u00e9terminisme g\u00e9n\u00e9tique des caract\u00e8res d\u2019int\u00e9r\u00eat agronomique et des voies de r\u00e9gulations des g\u00e8nes chez l\u2019olivier demeurent toujours au stade pr\u00e9liminaire.<\/p>\n\n\n\n

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La g\u00e9nomique de l\u2019olivier : une discipline \u00e9mergeante dans le programme de l\u2019INRA<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

Depuis longtemps, les travaux sur la g\u00e9n\u00e9tique occupent une composante principale dans le programme de recherche sur l\u2019olivier \u00e0 l\u2019INRA. Plusieurs travaux ont \u00e9t\u00e9 r\u00e9alis\u00e9s visant entre autres la caract\u00e9risation des ressources g\u00e9n\u00e9tiques moyennant des marqueurs mol\u00e9culaires. Diff\u00e9rentes ressources g\u00e9n\u00e9tiques ont \u00e9t\u00e9 caract\u00e9ris\u00e9es et \u00e9tudi\u00e9es, tels que les ressources locales dans diff\u00e9rentes r\u00e9gions du Maroc (El Bakkali et al., 2013), les vari\u00e9t\u00e9s \u00e9trang\u00e8res conserv\u00e9es en collections ex-situ de l\u2019INRA (Haouane et al., 2011 ; El Bakkali et al., 2019 & 2020) ainsi que l\u2019olivier sauvage collect\u00e9 au Maroc (Zunino et al., 2024). Les r\u00e9sultats de ces travaux ont mis en \u00e9vidence la richesse et la sp\u00e9cificit\u00e9 de la diversit\u00e9 g\u00e9n\u00e9tique contenues aussi bien dans les collections de l\u2019INRA que dans les populations locales au Maroc.<\/p>\n\n\n\n

Dans l\u2019objectif d\u2019approfondir les connaissances sur le g\u00e9nome de l\u2019olivier en exploitant les nouvelles avanc\u00e9es dans le domaine du s\u00e9quen\u00e7age haut-d\u00e9bit, un projet de recherche (ClimOliveMed\/ClimGenOlive ; https:\/\/www.climolivemed.com\/<\/a> ; 2022-2026) a \u00e9t\u00e9 mis en place impliquant deux consortiums ; marocain et fran\u00e7ais, avec un cofinancement des deux pays. Plusieurs \u00e9quipes de recherche contribuent \u00e0 ce projet ; l\u2019INRA Maroc, l\u2019Universit\u00e9 Cadi Ayyad, le CIRAD, l\u2019INRAe, l\u2019IRD et le CNRS. Le projet est construit \u00e0 base d\u2019une dimension multidisciplinaire consciente de l\u2019importance d\u2019int\u00e9grer divers outils d\u2019acquisition de la donn\u00e9e g\u00e9nomique et de traitement de l\u2019information acquise. Le projet vise \u00e0 combiner plusieurs technologies de s\u00e9quen\u00e7age (Short et Long-reads<\/em>) \u00e0 diff\u00e9rents niveaux de couverture (re-s\u00e9quen\u00e7age du g\u00e9nome complet de 200 vari\u00e9t\u00e9s et s\u00e9quen\u00e7age par capture de g\u00e8nes de 320 vari\u00e9t\u00e9s). Un deuxi\u00e8me objectif consiste \u00e0 mettre en place deux g\u00e9nomes de r\u00e9f\u00e9rence de tr\u00e8s haute qualit\u00e9 pour deux vari\u00e9t\u00e9s largement cultiv\u00e9es au Maroc et en France ; \u00ab Picholine marocaine \u00bb et \u00ab Picholine du Languedoc \u00bb, en combinant les derni\u00e8res technologies de s\u00e9quen\u00e7age \u00e0 celles de la cartographie g\u00e9n\u00e9tique classique. De plus, dans les deux prochaines ann\u00e9es, l\u2019exploitation de la richesse ph\u00e9notypique et g\u00e9notypique de la collection mondiale de Marrakech, avec plus de 300 vari\u00e9t\u00e9s d\u2019olivier identifi\u00e9es par les outils mol\u00e9culaires, est envisag\u00e9e \u00e0 travers l\u2019identification des associations g\u00e8nes-caract\u00e8res par l\u2019approche GWAS (Genome-Wide Association Studies<\/em>) en mettant l\u2019accent sur deux aspects cl\u00e9s li\u00e9s au changement climatique \u00e0 savoir l\u2019adaptation \u00e0 la s\u00e9cheresse et au manque du froid hivernal. La combinaison d\u2019approches repr\u00e9sente une des strat\u00e9gies cl\u00e9s dans le programme actuel de l\u2019INRA en exploitant la compl\u00e9mentarit\u00e9 dans le niveau de r\u00e9solution de l\u2019information apport\u00e9e par les deux approches ; GWAS et cartographie de liaison (QTL mapping<\/em>). Dans ce sens, des donn\u00e9es g\u00e9nomiques et ph\u00e9notypiques acquises dans le cadre des travaux pr\u00e9c\u00e9dents seront utilis\u00e9es pour construire des cartes g\u00e9n\u00e9tiques, \u00e0 partir des populations F1 d\u2019olivier, en vue d\u2019identifier et localiser des QTLs associ\u00e9s aux dates de floraison et \u00e0 la taille du fruit.<\/p>\n\n\n\n

Une attention particuli\u00e8re est d\u00e9di\u00e9e au stockage des ressources g\u00e9nomiques et au partage de l\u2019information g\u00e9n\u00e9r\u00e9e dans le cadre du programme. De ce fait, les donn\u00e9es (assemblage et annotation des g\u00e9nomes, les variants all\u00e9liques, les associations SNP-caract\u00e8res\u2026) seront mises en ligne sur un portail int\u00e9gratif incluant des outils de \u00ab\u00a0Genome Browser<\/em>\u00a0\u00bb accessible \u00e0 la communaut\u00e9 scientifique. Une premi\u00e8re version est d\u00e9j\u00e0 mise en ligne et sera compl\u00e9t\u00e9e au fur et \u00e0 mesure du traitement des donn\u00e9es g\u00e9nomiques.<\/p>\n\n\n\n

Gr\u00e2ce aux progr\u00e8s r\u00e9alis\u00e9s, jusqu\u2019\u00e0 pr\u00e9sent, dans l\u2019acquisition de l\u2019information g\u00e9nomique et dans le traitement bio-informatique de l\u2019information acquise, la collaboration au sein du consortium du projet avec des comp\u00e9tences compl\u00e9mentaires et des questions d\u2019int\u00e9r\u00eat commun, les chercheurs impliqu\u00e9s dans ces travaux auront une vision sans pr\u00e9c\u00e9dent sur les fonctions des g\u00e8nes de l\u2019olivier. L\u2019identification des g\u00e8nes potentiellement associ\u00e9s aux caract\u00e8res d\u2019int\u00e9r\u00eat agronomique \u00e0 savoir, les dates de floraison, les besoins en froid pour la floraison, l\u2019adaptation \u00e0 la s\u00e9cheresse, la taille du fruit, etc. ouvrira la voie \u00e0 de nouvelles perspectives dans la s\u00e9lection vari\u00e9tale. En effet, les questions examin\u00e9es et les r\u00e9sultats recherch\u00e9s permettront de pr\u00e9dire le ph\u00e9notype en fonction des conditions environnementales \u00e0 l\u2019aide des mod\u00e8les de pr\u00e9diction g\u00e9notype-ph\u00e9notype tout en limitant le co\u00fbt et le temps demand\u00e9s dans les essais d\u2019\u00e9valuation aux champs. Ces avanc\u00e9es vont inaugurer dans les ann\u00e9es prochaine, la nouvelle \u00e8re de s\u00e9lection g\u00e9nomique bas\u00e9e sur les avanc\u00e9es technologiques dans le s\u00e9quen\u00e7age haut-d\u00e9bit et le traitement bio-informatique rapide de l\u2019information.<\/p>\n\n\n\n

R\u00e9f\u00e9rences<\/strong> bibliographiques<\/strong> :<\/p>\n\n\n\n

Alagna F. et al. (2009) Comparative 454 pyrosequencing of transcripts from two olive genotypes during fruit development. BMC Genomics, 10, 399.<\/p>\n\n\n\n

Bazakos C. et al. (2012) Comparative transcriptome analysis of two olive cultivars in response to NaCl-stress. PLoS ONE, 7(8).<\/p>\n\n\n\n

Besnard, G. et al. (2018) On the origins and domestication of the olive: A review and perspectives. Annals of Botany, 121(3), 385\u2013403.<\/p>\n\n\n\n

Calvo-Polanco M. et al. (2019) Phenotypic and molecular traits determine the tolerance of olive trees to drought stress. Plant Physiol. Biochem. 139: 521-527.<\/p>\n\n\n\n

Cruz F. et al. (2016) Genome sequence of the olive tree, Olea europaea. GigaScience, 5(1).<\/p>\n\n\n\n

D\u2019Agostino N. et al. (2018) GBS-derived SNP catalogue unveiled wide genetic variability and geographical relationships of Italian olive cultivars. Sci. Rep. 8, 15877.<\/p>\n\n\n\n

El Bakkali A. et al. (2013) Genetic diversity of on-farm selected olive trees in Moroccan traditional olive orchards. Plant Genetic Resources 11(02): 97-105.<\/p>\n\n\n\n

El Bakkali A. et al. (2019) Characterization of worldwide olive germplasm banks of Marrakech (Morocco) and C\u00f3rdoba (Spain): Towards management and use of olive germplasm in breeding programs. PLoS ONE, 14(10).<\/p>\n\n\n\n

El Bakkali A. et al. (2020) Addressing the Challenge of Cultivars Identification and Authentication in Mediterranean Olive Collections: A Case Study in Morocco. European Scientific Journal 16(6):339-355<\/p>\n\n\n\n

Galla G. et al. (2009) Computational annotation of genes differentially expressed along olive fruit development. BMC Plant Biology, 9, 128.<\/p>\n\n\n\n

Giampetruzzi A. et al. (2016) Transcriptome profiling of two olive cultivars in response to infection by the CoDiRO strain of Xylella fastidiosa subsp. pauca. BMC Genomics, 17(1), 1\u201318.<\/p>\n\n\n\n

Grasso F. et al. (2017) The transcriptional response to the olive fruit fly (Bactrocera oleae) reveals extended differences between tolerant and susceptible olive (Olea europaea L.) varieties. PLoS ONE, 12(8).<\/p>\n\n\n\n

Haouane H. et al. (2011) Genetic structure and core collection of the World Olive Germplasm Bank of Marrakech: towards the optimised management and use of Mediterranean olive genetic resources. Genetica 139(9):1083-94.<\/p>\n\n\n\n

\u0130pek A. et al. (2016) SNP Discovery by GBS in Olive and the Construction of a High-Density Genetic Linkage Map. Biochem Genet. 54(3): 313-325.<\/p>\n\n\n\n

\u0130pek A. et al. (2017) Transcriptome-based SNP discovery by GBS and the construction of a genetic map for olive. Funct. Integr. Genomics 17: 493\u2013501.<\/p>\n\n\n\n

Jim\u00e9nez-Ruiz J. et al. (2019) The Transcriptome of Verticillium dahliae Responds Differentially Depending on the Disease Susceptibility Level of the Olive (Olea europaea L.) Cultivar. Genes, 10.<\/p>\n\n\n\n

Julca I. et al. (2020) Genomic evidence for recurrent genetic admixture during the domestication of Mediterranean olive trees (Olea europaea<\/em> L.). BMC Biol. 18, 148. <\/p>\n\n\n\n

Kaya H.B. et al. (2019) Genome wide association study of 5 agronomic traits in olive (Olea europaea L.). Sci. Rep. 9, 18764.<\/p>\n\n\n\n

Liu X. et al. (2020) Metabolome and transcriptome analyses reveal tissue-specific variations in gene expression and metabolites of olive. J. Plant Biol. 63, 73\u201382.<\/p>\n\n\n\n

Marchese A. et al. (2016) The first high-density sequence characterized SNP-based linkage map of olive (Olea europaea L. subsp. europaea) developed using genotyping by sequencing. Austra. J. Crop Sci. 10(6) :857-863.<\/p>\n\n\n\n

Mousavi S. et al. (2019) Physiological, epigenetic and genetic regulation in some olive cultivars under salt stress. Sci. Rep. 9: 1093.<\/p>\n\n\n\n

Mu\u00f1oz-M\u00e9rida A. et al. (2013) De novo assembly and functional annotation of the olive (Olea europaea) transcriptome. DNA Res. 20(1):93-108.<\/p>\n\n\n\n

Perez M. et al. (2017) Tolerance of olive (Olea europaea) cv Frantoio to Verticillium dahliae relies on both basal and pathogen-induced differential transcriptomic responses. New Phytol. 217, 671\u2013686.<\/p>\n\n\n\n

Ram\u00edrez-Tejero J.A. et al. (2020). Gene expression pattern in olive tree organs (Olea europaea<\/em> L.). Genes, 11(5).<\/p>\n\n\n\n

Rao G. et al. (2021) De novo assembly of a new Olea europaea genome accession using nanopore sequencing. Hortic. Res.<\/em> 8<\/em>, 64.<\/p>\n\n\n\n

Sadok I. et al. (2013) QTL Mapping of Flowering and Fruiting Traits in Olive. PLoS ONE, 8(5).<\/p>\n\n\n\n

Unver T. et al. (2017) Genome of wild olive and the evolution of oil biosynthesis. PNAS, 114<\/em>(44), E9413\u2013E9422.<\/p>\n\n\n\n

Wang L. et al. (2022) High-Quality Genome Assembly of Olea europaea subsp. cuspidata Provides Insights Into Its Resistance to Fungal Diseases in the Summer Rain Belt in East Asia. Front. Plant Sci. 13:879822.<\/p>\n\n\n\n

Zhu S. et al. (2019) Genetic Diversity Analysis of Olive Germplasm (Olea europaea L.) With Genotyping-by-Sequencing Technology. Front. Genet. 10:755. Zunino L. et al. (2024) Genomic evidence of genuine wild versus admixed olive populations evolving in the same natural environments in western Mediterranean Basin. PLoS ONE 19(1): e0295043.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Par : Lamoumni Othmane1,2, Khadari Bouchaib3,4, El Bakkali Ahmed2 1Universit\u00e9 Cadi Ayyad, Marrakech ; 2INRA, CRRA-Mekn\u00e8s ; 3AGAP Institut, CIRAD, Montpellier, France ; 4CBNMed Montpellier, France L\u2019olivier, arbre caract\u00e9ristique de la r\u00e9gion m\u00e9diterran\u00e9enne, se trouve confront\u00e9 aux contraintes li\u00e9es au changement climatique marqu\u00e9s par … Continuer la lecture →<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[1],"tags":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/mag.inrameknes.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/3563"}],"collection":[{"href":"https:\/\/mag.inrameknes.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/mag.inrameknes.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/mag.inrameknes.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/mag.inrameknes.info\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=3563"}],"version-history":[{"count":11,"href":"https:\/\/mag.inrameknes.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/3563\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":3627,"href":"https:\/\/mag.inrameknes.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/3563\/revisions\/3627"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/mag.inrameknes.info\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=3563"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/mag.inrameknes.info\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcategories&post=3563"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/mag.inrameknes.info\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Ftags&post=3563"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}