{"id":1651,"date":"2018-06-13T12:15:28","date_gmt":"2018-06-13T12:15:28","guid":{"rendered":"http:\/\/mag.inrameknes.info\/?p=1651"},"modified":"2018-06-13T12:20:40","modified_gmt":"2018-06-13T12:20:40","slug":"ressources-genetiques-de-lolivier-a-linra-atout-pour-le-programme-damelioration-genetique-par-dr-el-bakkali-ahmed-urapcrg-crra-meknes","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/mag.inrameknes.info\/?p=1651","title":{"rendered":"Ressources g\u00e9n\u00e9tiques de l\u2019olivier \u00e0 l\u2019INRA: Atout pour le programme d\u2019am\u00e9lioration g\u00e9n\u00e9tique. Par Dr. El Bakkali Ahmed (URAPCRG, CRRA Mekn\u00e8s)"},"content":{"rendered":"
\"Dr

Dr Ahmed El Bakkali (Biotechnologie et am\u00e9lioration des plantes, URAPCRG, CRRA Mekn\u00e8s)<\/p><\/div>\n

La conservation et la gestion des ressources phytog\u00e9n\u00e9tiques locales et \u00e9trang\u00e8res est l’une des principales missions de l\u2019Institut National de la Recherche Agronomique (INRA). De ce fait, une vingtaine d\u2019esp\u00e8ces fruiti\u00e8res sont en conservation dans des collections ex-situ<\/em> \u00e0 travers les diff\u00e9rents domaines exp\u00e9rimentaux de l\u2019INRA.<\/p>\n

Les ressources g\u00e9n\u00e9tiques repr\u00e9sentent un \u00e9norme r\u00e9servoir de g\u00e8nes et de caract\u00e8res \u00e0 exploiter dans les sch\u00e9mas de s\u00e9lection. Tout programme d\u2019am\u00e9lioration g\u00e9n\u00e9tique, pour toute esp\u00e8ce, est fond\u00e9 dans un premier temps sur la variabilit\u00e9 g\u00e9n\u00e9tique contenue dans le germoplasme. Par ailleurs, la n\u00e9cessit\u00e9 de satisfaire les besoins alimentaires a pouss\u00e9 la recherche agronomique vers de nouveaux programmes d\u2019am\u00e9lioration g\u00e9n\u00e9tique et de s\u00e9lection. Ainsi, l\u2019agriculture est pass\u00e9e d\u2019un mode traditionnel, exerc\u00e9 dans des agro-\u00e9cosyst\u00e8mes vivriers, \u00e0 un mode intensif bas\u00e9 le plus souvent sur des cultures monovari\u00e9tales. Toutefois, l\u2019\u00e9troite base g\u00e9n\u00e9tique des vari\u00e9t\u00e9s cultiv\u00e9es constitue un obstacle majeur au maintien de la productivit\u00e9 en raison de la vuln\u00e9rabilit\u00e9 des vari\u00e9t\u00e9s g\u00e9n\u00e9tiquement uniformes aux nouveaux stress biotiques et abiotiques.<\/p>\n

L\u2019olivier est l\u2019une des plus anciennes esp\u00e8ces fruiti\u00e8res \u00e9tudi\u00e9es \u00e0 l\u2019INRA. Vu l\u2019importance socio-\u00e9conomique du secteur \u00e0 l\u2019\u00e9chelle nationale et dans l\u2019objectif de r\u00e9pondre aux attentes de la fili\u00e8re, diff\u00e9rents programmes ont \u00e9t\u00e9 r\u00e9alis\u00e9s visant, entre autres, la collecte et la conservation du mat\u00e9riel local, l\u2019introduction et l\u2019\u00e9tude de comportement des vari\u00e9t\u00e9s \u00e9trang\u00e8res et la r\u00e9alisation de croisements afin d\u2019am\u00e9liorer les vari\u00e9t\u00e9s d\u00e9j\u00e0 existantes.<\/p>\n

I. Les collections des ressources g\u00e9n\u00e9tiques de l\u2019olivier \u00e0 l\u2019INRA<\/strong><\/p>\n

Trois types de collections sont install\u00e9es aux domaines exp\u00e9rimentaux de l\u2019INRA, particuli\u00e8rement aux domaines d\u2019Ain Taoujdate (CRRA-Mekn\u00e8s), de Tassaoute et d\u2019Ess\u00e2ada (CRRA-Marrakech) qui sont\u00a0: i) des collections de vari\u00e9t\u00e9s \u00e9trang\u00e8res\u00a0; ii) des collections de ressources g\u00e9n\u00e9tiques locales et iii) des collections de populations hybrides issues de croisements.<\/p>\n

\"Figure

Figure 1. Collection mondiale de l\u2019olivier au Domaine Exp\u00e9rimental de Tassaoute (INRA-CRRA Marrakech)<\/p><\/div>\n

Concernant les vari\u00e9t\u00e9s \u00e9trang\u00e8res, l\u2019INRA dispose de deux collections mondiales. La premi\u00e8re est install\u00e9e depuis les ann\u00e9es 50, au domaine exp\u00e9rimental d\u2019Ain Taoujdate, avec 78 vari\u00e9t\u00e9s provenant de 9 pays et la deuxi\u00e8me au domaine exp\u00e9rimental de Tassaoute install\u00e9e en 2002, sous l\u2019\u00e9gide du Conseil Ol\u00e9icole International dans le cadre du projet ResGen-T96\/97, avec 580 accessions correspondant \u00e0 350 vari\u00e9t\u00e9s bien identifi\u00e9es et issues de 14 pays m\u00e9diterran\u00e9ens. Les deux collections ont \u00e9t\u00e9 caract\u00e9ris\u00e9es moyennant des marqueurs mol\u00e9culaires et des caract\u00e8res li\u00e9s aux fruits et aux endocarpes. L\u2019objectif de cette caract\u00e9risation est double\u00a0: rectifier les d\u00e9nominations et r\u00e9v\u00e9ler les cas de synonymie et de variants somaclonaux, d\u2019une part, et contribuer \u00e0 l\u2019\u00e9tablissement d\u2019une base de donn\u00e9es sur la situation des ressources ol\u00e9icoles \u00e0 l\u2019\u00e9chelle m\u00e9diterran\u00e9enne, d\u2019autre part. La caract\u00e9risation a r\u00e9v\u00e9l\u00e9 des r\u00e9sultats int\u00e9ressants sur l\u2019importance de la diversit\u00e9 g\u00e9n\u00e9tique de la collection mondiale de Marrakech \u00e0 l\u2019\u00e9chelle m\u00e9diterran\u00e9enne en comparaison \u00e0 celle de la collection mondiale de Cordoue-Espagne install\u00e9e depuis les ann\u00e9es 70.<\/p>\n

Le deuxi\u00e8me type de collections comprend les ressources g\u00e9n\u00e9tiques ol\u00e9icoles locales. A cet effet, des efforts ont \u00e9t\u00e9 d\u00e9ploy\u00e9s par diff\u00e9rents chercheurs (Mekn\u00e8s et Marrakech) qui ont men\u00e9 plusieurs prospections, en tenant compte du savoir local des paysans, afin de collecter et conserver du mat\u00e9riel v\u00e9g\u00e9tal \u00e0 fort potentiel adaptatif. Les efforts ont permis de mettre en place des collections nationales r\u00e9f\u00e9rences repr\u00e9sentatives de la diversit\u00e9 ol\u00e9icole locale comprenant \u00e0 la fois des oliviers diff\u00e9rents de la Picholine marocaine, sur le plan morphologique et mol\u00e9culaire, et des vari\u00e9t\u00e9s mineures connues \u00e0 savoir\u00a0; Bouchouk, Bouchouika, Fakhfoukha, Meslala, Hamrani…etc. A titre d\u2019exemple, la collection d\u2019Ain Taoujdate contient plus de 60 accessions collect\u00e9es dans diff\u00e9rentes zones au Nord du Maroc dont l\u2019\u00e9valuation agronomique est en cours pour la s\u00e9lection de vari\u00e9t\u00e9s performantes et adapt\u00e9es aux conditions de culture pluviale.<\/p>\n

Le troisi\u00e8me type concerne la collection de populations hybrides. Il s\u2019agit d\u2019une\u00a0 collection de plus de 1600 arbres, install\u00e9e au domaine exp\u00e9rimental de Tassaoute, issue de 4 diff\u00e9rents croisements dont la picholine marocaine et ses clones (Menara et Haouzia) sont crois\u00e9s avec 4 vari\u00e9t\u00e9s \u00e9trang\u00e8res ayant des caract\u00e9ristiques appr\u00e9ci\u00e9es par les ol\u00e9iculteurs\u00a0qui sont :\u00a0Arbequine, Leccino, Picholine de Languedoc et Manzanille de Sevilla. Les premi\u00e8res s\u00e9lections ont permis de choisir et proposer cinq nouvelles vari\u00e9t\u00e9s au catalogue officiel\u00a0; Mechkat, Dalia, Tassaoute, Baraka et Agdal qui pr\u00e9sentent certaines caract\u00e9ristiques agronomiques plus performants que celles des parents. D\u2019autres travaux sont en cours de r\u00e9alisation par l\u2019\u00e9quipe du CRRA-Marrakech\u00a0afin de s\u00e9lectionner d\u2019autres g\u00e9notypes performants en ciblant plusieurs crit\u00e8res \u00e0 savoir\u00a0; une faible vigueur, un rendement \u00e9lev\u00e9 et stable, la r\u00e9sistance\/tol\u00e9rance aux maladies et ravageurs, une bonne qualit\u00e9 de l\u2019huile, etc.<\/p>\n

II. Valorisation des ressources g\u00e9n\u00e9tiques dans le programme d\u2019am\u00e9lioration de l\u2019olivier<\/strong><\/p>\n

L\u2019importance des ressources g\u00e9n\u00e9tiques ol\u00e9icoles est incontestable pour le programme d\u2019am\u00e9lioration g\u00e9n\u00e9tique. En effet, la variabilit\u00e9, aussi bien au niveau des g\u00e8nes qu\u2019au niveau des caract\u00e8res, au sein des collections repr\u00e9sente un atout \u00e0 exploiter par les chercheurs afin de valoriser la diversit\u00e9 g\u00e9n\u00e9tique tout en r\u00e9pondant aux diff\u00e9rents d\u00e9fis du secteur en particulier la diversification de la gamme vari\u00e9tale existante et la mise au point de nouvelles vari\u00e9t\u00e9s plus adapt\u00e9es aux conditions du pays. Deux aspects majeurs sont \u00e0 consid\u00e9rer\u00a0dans l\u2019exploitation et la valorisation de la diversit\u00e9 g\u00e9n\u00e9tique existante dans les collections de l\u2019INRA :<\/p>\n

II.1. S\u00e9lection directe de nouvelles vari\u00e9t\u00e9s\u00a0<\/span><\/em><\/strong><\/p>\n

L\u2019INRA a toujours \u0153uvr\u00e9 pour la s\u00e9lection de nouvelles vari\u00e9t\u00e9s adapt\u00e9es aux conditions locales. Cette mission reste une priorit\u00e9 pour le programme d\u2019am\u00e9lioration g\u00e9n\u00e9tique port\u00e9 par ses \u00e9quipes de recherche\u00a0; notamment celles de Mekn\u00e8s et Marrakech. D\u2019ailleurs, deux clones de la Picholine marocaine\u00a0(Menara et Haouzia) ont \u00e9t\u00e9 s\u00e9lectionn\u00e9s par l\u2019INRA \u00e0 partir du mat\u00e9riel local et cinq vari\u00e9t\u00e9s ont \u00e9t\u00e9 r\u00e9cemment propos\u00e9es pour l\u2019inscription au catalogue officiel. Ces programmes de s\u00e9lection prennent en consid\u00e9ration diff\u00e9rents crit\u00e8res \u00e0 savoir le rendement et la stabilit\u00e9 de la production, la teneur et la qualit\u00e9 de l\u2019huile et l\u2019adaptation au changement climatique. A titre d\u2019exemple, le programme de s\u00e9lection conduit au CRRA-Mekn\u00e8s et dont l\u2019objectif est la s\u00e9lection de nouveaux g\u00e9notypes \u00e0 partir des prospections r\u00e9alis\u00e9es dans la partie Nord du Maroc, a mis en \u00e9vidence des r\u00e9sultats prometteurs par la pr\u00e9s\u00e9lection de deux g\u00e9notypes plus performants que la vari\u00e9t\u00e9 Picholine marocaine sur diff\u00e9rent plans : une entr\u00e9e pr\u00e9coce en production (\u00e0 partir de la 3\u00e9me ann\u00e9e), la stabilit\u00e9 du rendement, la teneur en huile et bien d\u2019autres crit\u00e8res. De m\u00eame, d\u2019autres g\u00e9notypes sont en phase de s\u00e9lection ayant montr\u00e9 une tol\u00e9rance \u00e0 la s\u00e9cheresse en se basant sur les niveaux de rendement, de croissance v\u00e9g\u00e9tative et de floraison.<\/p>\n

II.2. Etude du d\u00e9terminisme g\u00e9n\u00e9tique des caract\u00e8res d\u2019int\u00e9r\u00eat agronomique<\/span><\/em><\/strong><\/p>\n

Le d\u00e9terminisme g\u00e9n\u00e9tique des caract\u00e8res d\u2019int\u00e9r\u00eat agronomique, ou les relations g\u00e8nes-caract\u00e8res, peut \u00eatre abord\u00e9 par l\u2019\u00e9tude de populations en s\u00e9gr\u00e9gation (ou populations hybrides), la cartographie de liaison ou QTL (Quantitative Traits Loci<\/em>), mais aussi par l\u2019\u00e9tude de g\u00e9notypes non-apparent\u00e9s par la g\u00e9n\u00e9tique d\u2019association (association mapping<\/em>). Malgr\u00e9 son importance, les \u00e9tudes du d\u00e9terminisme g\u00e9n\u00e9tique des caract\u00e8res agronomiques chez l\u2019olivier demeurent au stade pr\u00e9liminaire. Gr\u00e2ce aux avanc\u00e9es technologiques dans le s\u00e9quen\u00e7age haut-d\u00e9bit, la recherche du m\u00e9canisme g\u00e9n\u00e9tique des caract\u00e8res permettra dans un avenir proche d\u2019aborder la s\u00e9lection g\u00e9nomique en permettant la s\u00e9lection de g\u00e9notypes performants \u00e0 des stades pr\u00e9coces tout en limitant les essais d\u2019\u00e9valuation aux champs. De ce fait, la caract\u00e9risation mol\u00e9culaire des collections d\u2019olivier a permis de mettre en place des dispositifs g\u00e9n\u00e9tiques ad\u00e9quats pour mener des travaux \u00e0 long-terme sur la g\u00e9n\u00e9tique d\u2019association g\u00e8ne\/caract\u00e8re chez l\u2019olivier pour une meilleure valorisation de la diversit\u00e9 existante. De ce fait, une \u00ab\u00a0core collection\u00a0\u00bb a \u00e9t\u00e9 \u00e9tablie dans le cadre des travaux pr\u00e9c\u00e9dents permettant la capture de toute la diversit\u00e9 contenue dans les collections avec le minimum de vari\u00e9t\u00e9s possibles. Cette \u00ab\u00a0core collection\u00a0\u00bb est en cours d\u2019installation dans deux sites contrast\u00e9s\u00a0; Mekn\u00e8s et Marrakech, dans le cadre du M\u00e9ga-projet Olivier 2017-2020 pour une \u00e9valuation agronomique afin de\u00a0: i) d\u00e9termine l\u2019h\u00e9ritabilit\u00e9 et par cons\u00e9quent l\u2019effet de l\u2019environnement sur l\u2019expression des caract\u00e8res et ii) localiser les g\u00e8nes impliqu\u00e9s ou li\u00e9s \u00e0 l\u2019expression des caract\u00e8res. Dans ce sens, la collection des populations hydrides va servir, dans le cadre d\u2019un projet europ\u00e9en (BiorEsources For OlivicultuRe\u00a0; BEFORe, projet N. 645595) dont l\u2019INRA est partenaire, \u00e0 d\u00e9velopper une carte g\u00e9n\u00e9tique dense et consensus de l\u2019olivier moyennant le g\u00e9notypage par s\u00e9quen\u00e7age (Genotyping By Sequencing<\/em>). Ceci \u00a0mettra en place un outil pr\u00e9cieux, d\u00e9terminant et incontournable pour r\u00e9pondre \u00e0 la question de recherche li\u00e9e au d\u00e9terminisme g\u00e9n\u00e9tique des caract\u00e8res d\u2019int\u00e9r\u00eat agronomique et adaptatif.<\/p>\n

III. Conclusion <\/strong><\/p>\n

Les travaux de caract\u00e9risation r\u00e9alis\u00e9s sur les collections d\u2019olivier montrent une diversit\u00e9 g\u00e9n\u00e9tique \u00e9lev\u00e9e soulignant l\u2019importance de ces ressources g\u00e9n\u00e9tiques dans le programme d\u2019am\u00e9lioration g\u00e9n\u00e9tique conduit \u00e0 l\u2019INRA. Il ressort clairement l\u2019importance des plateformes disponibles pour les activit\u00e9s de recherche men\u00e9es sur l\u2019olivier \u00e0 l\u2019\u00e9chelle nationale mais aussi en collaboration avec d\u2019autres partenaires \u00e0 l\u2019\u00e9chelle internationale. Toutefois, d\u2019autres points sont \u00e0 prendre en consid\u00e9ration \u00e0 savoir\u00a0: (i) compl\u00e9ter les collections mondiales par d\u2019autres ressources g\u00e9n\u00e9tiques manquantes \u00e0 savoir celles de l\u2019Iran, de la Turquie, de la France et de la Jordanie ; (ii) mettre en place une seule collection nationale r\u00e9f\u00e9rence \u00e0 partir des diff\u00e9rentes collections install\u00e9es \u00e0 Marrakech et Mekn\u00e8s et \u00e9diter un catalogue des ressources ol\u00e9icoles locales et finalement (iii) exploiter l\u2019olivier sauvage (ol\u00e9astre ou Berri) \u00e0 travers sa collecte et sa valorisation en tenant compte de la diversit\u00e9 contenue au sein de ce pool g\u00e9n\u00e9tique et de son potentiel d\u2019adaptation aux conditions locales face aux changements climatiques qui constituent un nouveau d\u00e9fi \u00e0 prendre en consid\u00e9ration en ol\u00e9iculture.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

La conservation et la gestion des ressources phytog\u00e9n\u00e9tiques locales et \u00e9trang\u00e8res est l’une des principales missions de l\u2019Institut National de la Recherche Agronomique (INRA). De ce fait, une vingtaine d\u2019esp\u00e8ces fruiti\u00e8res sont en conservation dans des collections ex-situ \u00e0 travers … Continuer la lecture →<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[11,113],"tags":[109,33,214,22,115,184],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/mag.inrameknes.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/1651"}],"collection":[{"href":"https:\/\/mag.inrameknes.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/mag.inrameknes.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/mag.inrameknes.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/mag.inrameknes.info\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=1651"}],"version-history":[{"count":7,"href":"https:\/\/mag.inrameknes.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/1651\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":1702,"href":"https:\/\/mag.inrameknes.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/1651\/revisions\/1702"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/mag.inrameknes.info\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=1651"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/mag.inrameknes.info\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcategories&post=1651"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/mag.inrameknes.info\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Ftags&post=1651"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}