{"id":1490,"date":"2018-04-16T15:37:17","date_gmt":"2018-04-16T15:37:17","guid":{"rendered":"http:\/\/mag.inrameknes.info\/?p=1490"},"modified":"2018-04-20T10:18:01","modified_gmt":"2018-04-20T10:18:01","slug":"utilisation-des-marqueurs-moleculaires-dans-la-verification-de-lauthenticite-varietale-cas-du-figuier-ficus-carica-l-par-dr-jamal-charafi-chercheur-en-biotechnologie-et-amelioration-de","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/mag.inrameknes.info\/?p=1490","title":{"rendered":"Utilisation des marqueurs mol\u00e9culaires dans la v\u00e9rification de l\u2019authenticit\u00e9 vari\u00e9tale : cas du figuier (Ficus carica L.). Par Dr Jamal CHARAFI, Chercheur en Biotechnologie et am\u00e9lioration des plantes (CRRA Mekn\u00e8s)"},"content":{"rendered":"
\"Dr

Dr Jamal Charafi, Chercheur \u00e0 l’URAPCRG du CRRA Mekn\u00e8s<\/p><\/div>\n

La culture du figuier (Ficus carica<\/span><\/em> L.), tr\u00e8s ancienne et importante au Maroc, est cultiv\u00e9e dans diff\u00e9rentes r\u00e9gions sous conditions environnementales contrast\u00e9es. Le plan Maroc vert a trac\u00e9 une politique de d\u00e9veloppement de figuier bas\u00e9e sur l\u2019extension des superficies cultiv\u00e9es et la modernisation du secteur. Cette strat\u00e9gie est confront\u00e9e au probl\u00e8me de disponibilit\u00e9 des plants authentiques et des vari\u00e9t\u00e9s s\u00e9lectionn\u00e9es. Cependant, une grande diversit\u00e9 g\u00e9n\u00e9tique et une richesse vari\u00e9tale de cette culture ont \u00e9t\u00e9 mises en \u00e9vidence par de nombreuses \u00e9tudes au Maroc, surtout dans les agro\u00e9cosyst\u00e8mes des montagnes du nord. L\u2019identification des g\u00e9notypes par les agriculteurs se fait \u00e0 travers des caract\u00e8res morphologiques comme la taille et la forme du fruit et de la feuille, ainsi que la couleur de l\u2019\u00e9piderme. De ce fait, la culture du figuier reste confront\u00e9e \u00e0 un probl\u00e8me de confusion vari\u00e9tale, de synonymies et d\u2019homonymies. \u00a0<\/span>Les vari\u00e9t\u00e9s qui sont largement cultiv\u00e9es au Maroc sont de type polyclonale et elles pr\u00e9sentent des probl\u00e8mes d\u2019authentification.<\/span><\/p>\n

L\u2019am\u00e9lioration de la production passe par le choix du mat\u00e9riel v\u00e9g\u00e9tal performant et adapt\u00e9. L\u2019\u00e9tude de la variation g\u00e9n\u00e9tique intra-vari\u00e9tale est souvent confront\u00e9e \u00e0 l\u2019instabilit\u00e9 et au faible nombre de caract\u00e8res ph\u00e9notypiques discriminants.\u00a0 <\/span>La caract\u00e9risation mol\u00e9culaire a \u00e9t\u00e9 utilis\u00e9e pour contourner ces probl\u00e8mes et plusieurs types de marqueurs ont \u00e9t\u00e9 adopt\u00e9s dans l\u2019authentification vari\u00e9tale et l\u2019\u00e9tude de la diversit\u00e9 intra-vari\u00e9tale.\u00a0 <\/span>Les marqueurs microsatellites (SSR) sont parmi les plus adapt\u00e9s gr\u00e2ce \u00e0 leur stabilit\u00e9, polymorphisme \u00e9lev\u00e9, codominance et reproductibilit\u00e9. <\/span><\/p>\n

Etude de la diversit\u00e9 intra-vari\u00e9tale chez quatre types vari\u00e9taux de figuier<\/span><\/strong><\/p>\n

\"Arbre

Arbre phylog\u00e9n\u00e9tique des g\u00e9notypes du figuier \u00e9tudi\u00e9s bas\u00e9e sur la m\u00e9thode UPGMA et le calcul des distance<\/p><\/div>\n

Un travail d\u2019analyse de la diversit\u00e9 intra-vari\u00e9tale de quatre principaux types vari\u00e9taux cultiv\u00e9s au nord du Maroc a \u00e9t\u00e9 r\u00e9alis\u00e9 \u00e0 l\u2019aide de marqueurs microsatellites. Le choix a \u00e9t\u00e9 focalis\u00e9 sur le type \u2018Nabout\u2019, tr\u00e8s connu dans la zone de Taounate, \u2018El Quoti\u2019 et \u2018Massari\u2019 de la zone de Ouazzane et \u2018Ghoudane\u2019, tr\u00e8s r\u00e9pandu dans toute la zone nord du Maroc. \u00a0<\/span>Des \u00e9chantillons de feuilles ont \u00e9t\u00e9 pr\u00e9lev\u00e9s \u00e0 partir de plusieurs clones de chaque type vari\u00e9tal issu de plusieurs localit\u00e9s distinctes. Les m\u00eames vari\u00e9t\u00e9s du Domaine Exp\u00e9rimental d\u2019A\u00efn Taoujdate ont \u00e9t\u00e9 utilis\u00e9es comme r\u00e9f\u00e9rence.\u00a0 <\/span>La caract\u00e9risation mol\u00e9culaire a \u00e9t\u00e9 faite \u00e0 l\u2019aide de six locus SSR qui ont \u00e9t\u00e9 d\u00e9termin\u00e9s comme cl\u00e9s d\u2019identification vari\u00e9tale chez le figuier.<\/span><\/p>\n

L\u2019analyse des donn\u00e9es mol\u00e9culaires obtenus montre parfaitement que les quatre vari\u00e9t\u00e9s sont tr\u00e8s distinctes g\u00e9n\u00e9tiquement. Un regroupement hi\u00e9rarchique par type vari\u00e9tal a \u00e9t\u00e9 ressorti sauf pour les clones de \u2018Ghoudane\u2019 (clones GT et GE) qui sont subdivis\u00e9s en 2 sous-groupes diff\u00e9rents.<\/span>\u00a0<\/span><\/p>\n

\"R\u00e9partition

R\u00e9partition des g\u00e9notypes du figuier \u00e9tudi\u00e9s dans le plan d\u00e9fini par les axes 1, 2 et 3 de l\u2019AFC de l\u2019analyse par les marqueurs SSR<\/p><\/div>\n

Ainsi, une distinction entre les g\u00e9notypes de la r\u00e9gion de Taounate et ceux la r\u00e9gion d\u2019Ouazzane est \u00e9vidente, ce qui montre la pr\u00e9sence d\u2019une structuration phylo-g\u00e9ographique entre les deux zones.<\/p>\n

L\u2019analyse intra-vari\u00e9tale montre une diversit\u00e9 tr\u00e8s faible au sien des deux types vari\u00e9taux \u2018El Qouti\u2019 et \u2018Massari\u2019.\u00a0 <\/span>De petites diff\u00e9rences all\u00e9liques ont \u00e9t\u00e9 \u00e9lucid\u00e9es entre quelques clones qui seraient dues, vraisemblablement, \u00e0 des variations somaclonales ou une confusion vari\u00e9tale (Synonymie \/ homonymie). \u00a0<\/span>Cependant, le type \u2018Naboute\u2019 pr\u00e9sente une grande diversit\u00e9 g\u00e9n\u00e9tique intra-vari\u00e9tale. Ce r\u00e9sultat pourrait \u00eatre expliqu\u00e9 par le fait que la d\u00e9nomination \u00ab\u00a0Naboute\u00a0\u00bb serait utilis\u00e9e par les agricultures de la r\u00e9gion de Taounate pour tout cultivar de couleur claire, de bon calibre et apte au s\u00e9chage. Pour les clones de \u2018Ghoudane\u2019, on constate la pr\u00e9sence de deux pools g\u00e9n\u00e9tiques diff\u00e9rents. Les diff\u00e9rences pomologiques entres les fruits des clones confirment cette diversit\u00e9. Les deux formes pyriforme et globuleuse sont souvent rencontr\u00e9es. En effet, plusieurs figues \u00e0 \u00e9piderme noir sont nomm\u00e9es \u2018Ghoudane\u2019.<\/span><\/p>\n

Ces r\u00e9sultats obtenus concordent avec ceux de plusieurs \u00e9tudes ant\u00e9rieures ayant sugg\u00e9r\u00e9 que les faibles diff\u00e9rences all\u00e9liques seraient dues au ph\u00e9nom\u00e8ne de variation somaclonale. Par contre, les grandes diff\u00e9rences all\u00e9liques montrent que les clones sont g\u00e9n\u00e9tiquement diff\u00e9rents et les d\u00e9nominations seraient probablement dues aux confusions vari\u00e9tales et au probl\u00e8me d\u2019homonymie. <\/span><\/p>\n

Conclusion<\/span><\/strong><\/p>\n

Au niveau des peuplements locaux de figuier marocains, des \u00e9tudes ont signal\u00e9 l\u2019existence de vari\u00e9t\u00e9s polyclonales, des probl\u00e8mes de confusion vari\u00e9tal ainsi que d\u2019homonymies et de synonymies. La v\u00e9rification de l\u2019authenticit\u00e9 vari\u00e9tale de certaines types vari\u00e9taux a montr\u00e9 que le profil vari\u00e9tal Naboute et Ghoudane est tr\u00e8s diversifi\u00e9. Cependant, Les vari\u00e9t\u00e9s El Qouti et Massari sont en grande partie stables et authentiques. Un travail approfondi, faisant appel \u00e0 la s\u00e9lection clonale, est n\u00e9cessaire pour exploiter cette polyclonalit\u00e9 et s\u00e9lectionner des clones productifs et pr\u00e9sentant de bonnes performances agronomiques et technologiques.<\/span><\/strong><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

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